מכון בני יששכר הוקם ב-1983 ולקח על עצמו לחקור ולפרסם מורשת יהדות ספרד שלא זכתה עד כה לתודעה הראויה לה. בגלל שבתי דפוס הגיעו למדינות ספרד והמזרח באיחור רב, הדבר גרם לפיגור בנוגע להדפסת יצירותיהם של הרבנים, אפילו אלה שהודפסו, ביטול יישובם הטבעי גרם לשכחת המורשת, דבר שהיה מובן מאליו לפני הפיזור הגדול של הקהילות הספרדיות במאה ה-20.

דאגת הפרנסה וההשכלה הכללית גרמו לשכחה הזאת ונמצה דור שחושב שלא היו חכמים במדינותיהם. מכון בני יששכר בא לחשוף את כל העבר המפואר של כל קהילה ספרדית, חכמיה, פרנסיה ומנהיגיה המבוססים על אדני פז.

עד כה יצאו לאור ע"י המכון כ-300 ספרים בכל מקצועות התורה. אנו גם מעודדים מחברים בני ימינו לפרסם את חיבוריהם.

מכון בני יששכר הקים מספר קרנות:

אוצרות המגרב: המכסה את צפון אפריקה, ממרוקו עד לוב.

קרן ארם צובה: התחלנו להוציא לאור את ספריו של רבי חיים הכהן מארם צובה. מתוך 3 כרכים, החלק הראשון יצא לאור ברוב פאר והדר.

קרן מרוקו-הספרדי: מרוקו מחולקת לשתי קהילות נפרדות: בצפון הקהילה דוברת ספרדית והמרכז והדרום דוברי צרפתית וערבית. טיטואן היא העיר המרכזית של מרוקו הספרדית ובה היו חכמים ענקי רוח שהשאירו יצירות מאוד חשובות. מתוך 20 ספרים שבפרויקט, יצאו כבר כ-8 ספרים.

קרן חכמי אלג'יריה: חריצותם של יהודי אלג'יריה זיכתה אותנו בהוצאה לאור של יצירותיהן של משפחות מיוחסות: שוראקי, חלימי, גיג', ללום, זרקא, עייאש, מאיר דרמון וכו'...